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  • 技術(shù)文章

    PCR儀百科簡介

    2013-08-19 10:09:12  來源:*

    摘要:簡單的說,PCR就是利用DNA聚合酶對特定基因做體外或試管內(nèi)InVitro的大量合成,基本上它是利用DNA聚合酶進(jìn)行專一性的連鎖復(fù)制。目前常用的技術(shù),可以將一段基因復(fù)制為原來的一百億至一千億倍。根據(jù)DNA擴(kuò)增的目的和檢測的標(biāo)準(zhǔn),可以將PCR儀分為普通PCR儀,梯度PCR儀,原位PCR儀,實時熒光定量PCR儀四類。

      PCR簡介

      PCR的要素

      基本的PCR須具備

      1.要被復(fù)制的DNA模板 Template

      2.界定復(fù)制范圍兩端的引物Primers.

      3.DNA聚合酶Taq. Polymearse

      4.合成的原料(四種脫氧核苷酸)及水。

      PCR儀工作原理

      利用升溫使DNA變性,用限制性內(nèi)切酶使DNA雙鏈解鏈,在聚合酶的作用下使單鏈復(fù)制成雙鏈,進(jìn)而達(dá)到基因復(fù)制的目的

      PCR的反應(yīng)包括三個主要步驟

      分 別是1. Denaturation 2. Annealing of primers,3. Extension of primers。 所謂 Denaturing乃是將DNA加熱(至90~95℃)變性, 將雙股的DNA加熱后轉(zhuǎn)為單股DNA以做為復(fù)制的模板. 而Annealing 則是令 Primers于一定的溫度下(冷卻至55~60℃)附著于模板DNA兩端。 *后在DNA聚合酶e.g. Taq-polymerase 的作用下(加熱至70~75℃)進(jìn)行引物的延長 Extension of primers及另一股的合成。

      PCR的*早設(shè)想核酸研究已有100多年的歷史,本世紀(jì)60年代末、70年代初人們致力于研究基因的體外分離技術(shù),Korana于1971年*早提出核酸體外擴(kuò)增的設(shè)想:“經(jīng)過DNA變性,與合適的引物雜交,用DNA聚合酶延伸引物,并不斷重復(fù)該過程便可克隆tRNA基因”。

      PCR的實現(xiàn)

      1985年美國PE-Cetus公司人類遺傳研究室的Mullis 等發(fā)明了具有劃時代意義的聚合酶鏈反應(yīng)。其原理類似于DNA的體內(nèi)復(fù)制

      PCR的改進(jìn)與完善

      Mullis*初使用的DNA聚合酶是大腸桿菌 DNA 聚合酶 I 的Klenow片段,其缺點是:

     、貹lenow酶不耐高溫, 90℃會變性失活,每次循環(huán)都要重新加。

     、谝镦溠由旆磻(yīng)在37℃下進(jìn)行,容易發(fā)生模板和引物之間的堿基錯配,其PCR產(chǎn)物特異性較差,合成的

      DNA片段不均一。此種以Klenow酶催化的PCR技術(shù)雖較傳統(tǒng)的基因擴(kuò)增具備許多突出的優(yōu)點,

      但由于Klenow酶不耐熱,在DNA模板進(jìn)行熱變性時,會導(dǎo)致此酶鈍化,每加入一次酶只能完成

      一個擴(kuò)增反應(yīng)周期,給PCR技術(shù)操作程序添了不少困難。這使得PCR技術(shù)在一段時間內(nèi)沒能引

      起生物醫(yī)學(xué)界的足夠重視。

      1988年初,Keohanog改用T4 DNA聚合酶進(jìn)行PCR,其擴(kuò)增的DNA片段很均一,真實性也較

      高,只有所期望的一種DNA片段。但每循環(huán)一次,仍需加入新酶。

      1988年Saiki 等從溫泉中分離的一株水生嗜熱桿菌thermus aquaticus 中提取到一種

      耐熱DNA聚合酶。此酶具有以下特點:①耐高溫,在70℃下反應(yīng)2h后其殘留活性大于原來的

      90%,在93℃下反應(yīng)2h后其殘留活性是原來的60%,在95℃下反應(yīng)2h后其殘留活性是原來的40

      %。②在熱變性時不會被鈍化,不必在每次擴(kuò)增反應(yīng)后再加新酶。③大大提高了擴(kuò)增片段特異

      性和擴(kuò)增效率,增加了擴(kuò)增長度2.0Kb。由于提高了擴(kuò)增的特異性和效率,因而其靈敏性也

      大大提高。為與大腸桿菌多聚酶IKlenow片段區(qū)別,將此酶命名為TaqDNA多聚酶Taq DNA

      Polymerase。此酶的發(fā)現(xiàn)使PCR廣泛的被應(yīng)用。

      PCR儀的分類

      普通的PCR儀

      把一次PCR擴(kuò)增只能運(yùn)行一個特定退火溫度的PCR儀,叫傳統(tǒng)的PCR儀,也叫普通PCR儀。如果要做不同的退火溫度需要多次運(yùn)行。主要是做簡單的,對目的基因退火溫度的擴(kuò)增。該儀器主要應(yīng)用于科研研究,教學(xué),醫(yī)學(xué)臨床,檢驗檢疫等機(jī)構(gòu)。

      梯度PCR儀

      把一次性PCR擴(kuò)增可以設(shè)置一系列不同的退火溫度條件(溫度梯度),通常有12種溫度梯度,這樣的儀器就叫梯度PCR儀。因為被擴(kuò)增的不同DNA片段,其*適退火溫度事不同,通過設(shè)置一系列的梯度退火溫度進(jìn)行擴(kuò)增,從而一次性PCR擴(kuò)增,就可以篩選出表達(dá)量高的*適退火溫度,進(jìn)行有效的擴(kuò)增。主要用于研究未知DNA退火溫度的擴(kuò)增,這樣節(jié)約成本的同時也節(jié)約了時間。主要用于科研,教學(xué)機(jī)構(gòu)。梯度PCR儀,在不設(shè)置梯度的情況下也可以做普通PCR擴(kuò)增。

      原位PCR儀

      用于從細(xì)胞內(nèi)靶DNA的定位分析的細(xì)胞內(nèi)基因擴(kuò)增儀,如病源基因在細(xì)胞的位置或目的基因在細(xì)胞內(nèi)的作用位置等。是保持細(xì)胞或組織的完整性,使PCR反應(yīng)體系滲透到組織和細(xì)胞中,在細(xì)胞的靶DNA所在的位置上進(jìn)行基因擴(kuò)增,不但可以檢測到靶DNA,又能標(biāo)出靶序列在細(xì)胞內(nèi)的位置,于分子和細(xì)胞水平上研究疾病的發(fā)病機(jī)理和臨床過程及病理的轉(zhuǎn)變有重大的實用價值。

      實時熒光定量PCR儀

      在普通PCR儀的基礎(chǔ)上增加一個熒光信號采集系統(tǒng)和計算機(jī)分析處理系統(tǒng),就成了熒光定量PCR儀。其PCR擴(kuò)增原理和普通PCR儀擴(kuò)增原理相同,只是PCR擴(kuò)增時加入的引物是利用同位素、熒光素等進(jìn)行標(biāo)記,使用引物和熒光探針同時與模板特異性結(jié)合擴(kuò)增。擴(kuò)增的結(jié)果通過熒光信號采集系統(tǒng)實時采集信號連接輸送到計算機(jī)分析處理系統(tǒng)得出量化的實時結(jié)果輸出。把這PCR儀叫做實時熒光定量PCR儀(qPCR儀)。熒光定量PCR儀有單通道,雙通道,和多通道。當(dāng)只用一種熒光探針標(biāo)記的時候,選用單通道,有多熒光標(biāo)記的時候用多通道。單通道也可以檢測多熒光的標(biāo)記的目的基因表達(dá)產(chǎn)物,因為一次只能檢測一種目的基因的擴(kuò)增量,需多次擴(kuò)增才能檢測完不同的目的基因片段的量。該儀器主要用于醫(yī)學(xué)臨床檢測,生物醫(yī)藥研發(fā),食品行業(yè),科研院校等機(jī)構(gòu)。

      獲得諾貝爾獎的PCR技術(shù)

      1995年,美國科學(xué)家Mulis眾望所歸地獲得了諾貝爾化學(xué)獎,他所取得的成就是發(fā)明了PCR技術(shù)。

      PCR,中文譯為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),其實是一種DNA的快速擴(kuò)增技術(shù),其擴(kuò)增效率之高就象核裂變的“鏈?zhǔn)椒磻?yīng)”那樣。PCR技術(shù)通過兩個短的稱為引物的 DNA小片段和一種耐熱的酶的作用,可以在3個小時內(nèi)把特定的DNA量提高1000萬倍。這種技術(shù)一問世,立刻引起了分子生物學(xué)研究的一場革命,人們利用 這種轟動全世界的技術(shù)很快就把微觀領(lǐng)域的生物學(xué)研究大大地往前推了一步?梢赃@么說,PCR技術(shù)使分子生物學(xué)研究一下子獲得了突破,而且隨著PCR技術(shù)的 日趨完善,PCR在人類社會生活中的應(yīng)用也越來越廣泛。比如說在“DNA指紋” 中我們提到,科學(xué)家們只需要一根頭發(fā)甚至一個細(xì)胞就可以完成DNA指紋的鑒定工作,這里實際上就要采用PCR技術(shù),因為一個細(xì)胞中的DNA含量實在太少 了,人們根本不可能檢測到它的指紋;有了PCR技術(shù)就好辦了,通過PCR技術(shù)把這個細(xì)胞中的DNA片斷擴(kuò)增1000萬倍,這樣DNA量就足夠作指紋鑒定了。 再比如,在醫(yī)院里檢驗血液中的某種*,有時*量極少(例如有的艾滋病*攜帶者),通過傳統(tǒng)的檢查方法費(fèi)力又費(fèi)時,這時PCR技術(shù)也許就可以幫上忙。 可以先選定這種*DNA上的一段DNA,設(shè)計合適的引物DNA,然后通過PCR技術(shù)一擴(kuò)增很快就可以判斷出血樣中是否擴(kuò)增出了大量的DNA,如果是的 話,那么就說明血樣中帶有該種*了。PCR方法不但有極高的靈敏度,而且可以同時一次做近百個擴(kuò)增反應(yīng),省時省力效率高。

      PCR技術(shù)神奇就神奇在以下幾個特點上:一是被擴(kuò)增的DNA所需量極小,理論上講一個分子就可以用于擴(kuò)增了;二是擴(kuò) 增效率高,目的基因的量成指數(shù)形式擴(kuò)增,幾個小時就擴(kuò)增1000萬倍以上,F(xiàn)在PCR技術(shù)已經(jīng)被廣泛地應(yīng)用于生命科學(xué)研究、食品衛(wèi)生、醫(yī)療、法醫(yī)及環(huán)境監(jiān) 測等諸多方面,真不愧是“獲得諾貝爾獎”的好技術(shù)!


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